Altfel spus, organele sexuale nu sunt bine diferenţiate, ci ambigue, putând semăna mai mult fie cu organele sexuale feminine, fie cu cele masculine, în funcţie de nivelul de testosteron primit de făt în uter. De altfel, cuvântul „hermafrodit” îşi are originea prin asocierea a două nume proprii greceşti – Herma, o zeiţă, şi Phrodite, un zeu. Se estimează că aproximativ 5% din totalul tulburărilor de diferenţiere sexuală sunt atribuite hermafroditismului adevărat. Deşi este oarecum similară disgeneziei gonadale mixte, intersexualitatea gonadică diferă prin anumite aspecte. Cauza intersexualităţii gonadice nu a fost descoperită până în prezent, însă diverse studii pe animale de laborator au indicat că ar putea exista o asociere între expunerea la pesticide şi dezvoltarea acestei afecţiuni, ca urmare a producţiei excesive a anumitor hormoni masculini sau feminini, ceea ce determină o dezvoltare ambiguă a organelor sexuale.